MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Acidilobus saccharovorans 345-15 chromosome

Total Repeats: 2646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014374	AGTT	2	8	196290	196297	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
502	NC_014374	TAT	2	6	196321	196326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_014374	CG	3	6	198741	198746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
504	NC_014374	GCC	2	6	199859	199864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_014374	GCC	2	6	199892	199897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_014374	GGT	2	6	199917	199922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_014374	CGG	2	6	199941	199946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_014374	ACT	3	9	199951	199959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_014374	AAT	2	6	200337	200342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_014374	TTG	2	6	200455	200460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_014374	GCA	2	6	200626	200631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_014374	GCG	2	6	200665	200670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_014374	TAA	2	6	201816	201821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_014374	AGC	2	6	201910	201915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_014374	ACC	2	6	203224	203229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_014374	CAC	2	6	205492	205497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_014374	TAAT	2	8	205499	205506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014374	GTA	2	6	205507	205512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_014374	CGCCT	2	10	205584	205593	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
520	NC_014374	CTA	2	6	205603	205608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_014374	CTC	2	6	205687	205692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_014374	TCCC	2	8	205755	205762	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
523	NC_014374	ATT	2	6	205771	205776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_014374	AGC	2	6	205837	205842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_014374	TGC	2	6	205855	205860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_014374	GAG	2	6	206181	206186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_014374	TAG	2	6	206225	206230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_014374	GGT	2	6	206256	206261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_014374	GCCAC	2	10	206267	206276	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
530	NC_014374	AGGCA	2	10	206328	206337	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
531	NC_014374	TAC	2	6	206383	206388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_014374	GC	3	6	206390	206395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
533	NC_014374	TTA	2	6	206407	206412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_014374	CT	3	6	207420	207425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
535	NC_014374	CCT	2	6	207426	207431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_014374	AT	3	6	207437	207442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_014374	CCT	2	6	207473	207478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_014374	GGC	2	6	207775	207780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_014374	GAT	2	6	207829	207834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_014374	CT	4	8	207861	207868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_014374	CCT	2	6	207933	207938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_014374	TTA	2	6	207945	207950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_014374	CAG	2	6	207977	207982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_014374	C	6	6	210482	210487	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
545	NC_014374	AAT	2	6	210535	210540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_014374	ACT	2	6	212509	212514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_014374	TAGTT	2	10	212545	212554	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
548	NC_014374	CCCT	2	8	213131	213138	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
549	NC_014374	ACTT	2	8	213144	213151	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
550	NC_014374	GGC	2	6	213203	213208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_014374	ATT	2	6	213260	213265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_014374	AT	3	6	213272	213277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_014374	TATT	2	8	215985	215992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014374	AGC	2	6	216025	216030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_014374	AGG	2	6	216162	216167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_014374	GGC	2	6	216183	216188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_014374	GTT	2	6	216194	216199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_014374	CCT	2	6	221087	221092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_014374	AGGCA	2	10	221103	221112	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
560	NC_014374	TAA	2	6	221142	221147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_014374	GAG	2	6	221204	221209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_014374	CAG	2	6	221241	221246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_014374	TTA	2	6	222230	222235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_014374	TTA	2	6	222249	222254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_014374	CCT	2	6	225211	225216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_014374	CTTTT	2	10	225241	225250	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
567	NC_014374	TCTA	2	8	229243	229250	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
568	NC_014374	GCAT	2	8	229291	229298	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
569	NC_014374	CTG	2	6	231593	231598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_014374	TCT	2	6	231608	231613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_014374	TTA	2	6	232084	232089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_014374	GCTG	2	8	232227	232234	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
573	NC_014374	CTTCA	2	10	234032	234041	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
574	NC_014374	TAT	2	6	234926	234931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_014374	GGC	2	6	234945	234950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_014374	AGT	2	6	235576	235581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_014374	GGAT	2	8	235623	235630	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
578	NC_014374	TTG	2	6	235717	235722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_014374	CAT	2	6	235769	235774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_014374	TGA	2	6	235793	235798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_014374	AGA	2	6	235815	235820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014374	TGC	2	6	235878	235883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_014374	GCAAAT	2	12	235899	235910	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
584	NC_014374	CTATA	2	10	235971	235980	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
585	NC_014374	GGT	2	6	236561	236566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_014374	CAT	2	6	238058	238063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_014374	CTAAG	2	10	239507	239516	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
588	NC_014374	TTTC	2	8	239603	239610	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
589	NC_014374	GTG	2	6	239624	239629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_014374	CTG	2	6	241138	241143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_014374	TAC	2	6	241163	241168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_014374	CTTAA	2	10	241903	241912	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
593	NC_014374	TGT	2	6	243900	243905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014374	TCCT	2	8	246699	246706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
595	NC_014374	TTC	2	6	246742	246747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_014374	CGA	2	6	247259	247264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_014374	GTC	2	6	247266	247271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_014374	ATC	2	6	247274	247279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_014374	TGC	2	6	247312	247317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_014374	GCA	2	6	247371	247376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_014374	TGG	2	6	247400	247405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_014374	TAG	2	6	247417	247422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_014374	AGCCTT	2	12	249163	249174	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_014374	C	6	6	249350	249355	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
605	NC_014374	GAA	2	6	249453	249458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_014374	ATTAAT	2	12	249498	249509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_014374	CAA	2	6	249511	249516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_014374	AT	3	6	249611	249616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_014374	AGG	2	6	249623	249628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_014374	TGA	2	6	249634	249639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_014374	ATT	2	6	249660	249665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_014374	AGA	2	6	249672	249677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_014374	AGGG	2	8	249761	249768	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
614	NC_014374	CAA	2	6	249798	249803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_014374	TC	3	6	249827	249832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_014374	AAC	2	6	249876	249881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_014374	AGC	2	6	249905	249910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_014374	AAT	2	6	250002	250007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_014374	GTT	2	6	250015	250020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014374	TAA	2	6	250032	250037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_014374	A	6	6	250085	250090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_014374	AAACG	2	10	250141	250150	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
623	NC_014374	GGT	2	6	252240	252245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_014374	TGATT	2	10	252625	252634	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
625	NC_014374	GCCC	2	8	252674	252681	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
626	NC_014374	CTCTG	2	10	253528	253537	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
627	NC_014374	TCA	2	6	254580	254585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_014374	CTTT	2	8	254603	254610	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
629	NC_014374	TAAA	2	8	254629	254636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_014374	CTT	2	6	254649	254654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_014374	CAC	2	6	256762	256767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_014374	TC	3	6	256772	256777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_014374	GCTA	2	8	256920	256927	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
634	NC_014374	CG	3	6	256948	256953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
635	NC_014374	AG	3	6	257714	257719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
636	NC_014374	TGGAA	2	10	258239	258248	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
637	NC_014374	CT	3	6	258326	258331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
638	NC_014374	ACA	2	6	258361	258366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_014374	CAGG	2	8	258384	258391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
640	NC_014374	CCG	2	6	258393	258398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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642	NC_014374	GGT	2	6	258472	258477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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656	NC_014374	AACTT	2	10	265232	265241	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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662	NC_014374	GGA	2	6	268860	268865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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673	NC_014374	TGG	2	6	269297	269302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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695	NC_014374	AG	3	6	286925	286930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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712	NC_014374	GCT	2	6	297747	297752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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758	NC_014374	TCC	2	6	338341	338346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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761	NC_014374	GCTA	2	8	344482	344489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
762	NC_014374	TAT	2	6	350760	350765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
763	NC_014374	AGC	2	6	350790	350795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
764	NC_014374	CTT	2	6	353814	353819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
765	NC_014374	CA	3	6	353862	353867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
766	NC_014374	TAAGG	2	10	353868	353877	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
767	NC_014374	GCCCTA	2	12	357482	357493	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
768	NC_014374	TGAG	2	8	359639	359646	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
769	NC_014374	TCG	2	6	360230	360235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
770	NC_014374	TCC	2	6	360292	360297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
771	NC_014374	C	6	6	360443	360448	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
772	NC_014374	ATG	2	6	360530	360535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
773	NC_014374	AGG	2	6	360562	360567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1000	NC_014374	TTAC	2	8	503375	503382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

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